Если слова-предложения ДА, НЕТ не связаны с основным предложением, они отделяются запятой, восклицательным, вопросительным знаком или многоточием. Нет, не хочу. Да! Сейчас. Нет? Ты шутишь? Да... Я согласна.
Различай слова ДА, НЕТ - члены предложения: У меня нет денег. (В этом предложении НЕТ - это сказуемое.)